โรงเรียนวัดป่าประดู่ เดิมเป็นโรงเรียนระดับประถมศึกษา สังกัดสำนักงานคณะกรรมการประถมศึกษาแห่งชาติ มีชื่อว่า “โรงเรียนวัดป่าประดู่
(สหมิตรสามัคคี)” ตั้งอยู่เลขที่ 136 ถนนสุขุมวิท ตำบลท่าประดู่ อำเภอเมืองระยอง ใช้ที่ดินของวัดป่าประดู่ ซึ่งอนุญาตให้กรมสามัญศึกษาใช้เป็นที่ตั้งของโรงเรียน จำนวน 17 ไร่ 1 งาน 25 ตารางวา เริ่มเปิดสอนครั้งแรก
เมื่อ พ.ศ. 2465 อาศัยศาลาการเปรียญของวัดป่าประดู่ ครูใหญ่คนแรกคือ พระศิลป์ชัย ดัชนีย์ ต่อมาได้สร้างอาคารเรียนถาวรขึ้นในเนื้อที่ดังกล่าว
พ.ศ. 2517 กรมสามัญศึกษาได้อนุมัติให้เปิดสอนระดับมัธยมศึกษาตอนต้นขึ้น ในระยะต่อมาได้มีเหตุขัดข้องบางประการ ทางกรมสามัญศึกษาให้โอนนักเรีนไปเรียนที่โรงเรียนระยองวิทยาคม
พ.ศ. 2518 เนื่องจากขาดอัตรากำลังที่จะจัดสรรให้ จึงเหลือเปิดสอนระดับประถมศึกษาอย่างเดียว
พ.ศ. 2524 ได้แปรสภาพจากโรงเรียนประถมศึกษามาเป็นโรงเรียนมัธยมศึกษาอีกครั้งหนึ่งตามประกาศของกระทรวงศึกษาธิการ ประกาศ
ณ วันที่ 31 กรกฎาคม 2524 ให้ตั้งเป็นโรงเรียนเปิดสอนระดับมัธยมศึกษาตอนต้น ตั้งแต่วันที่ 19 พฤษภาคม 2524 (นายล้วน รอดทอง ศึกษาธิการจังหวัดสมัยนั้น รักษาการแทนอาจารย์ใหญ่)
พ.ศ. 2567 ได้โอนอสังหาริมทรัพย์ต่างๆ มาเป็นของโรงเรียน
(จากโรงเรียนระดับประถมศึกษา) เมื่อวันที่ 16 เมษายน 2527 ตามหนังสือจังหวัดที่ รย 0030/6953 ลงวันที่ 24 เมษายน พ.ศ. 2537 เว้นอาคาร 008 ด้านตะวันออก ซึ่งสำนักงานการประถมศึกษาจังหวัดสงวนไว้ก่อน
(ต่อมาภายหลังอนุมัติให้รื้อและโอนวัสดุต่างๆ ของอาคารให้แก่โรงเรียน)
พ.ศ. 2530 กรมสามัญศึกษาอนุมัติให้เปิดระดับมัธยมศึกษาตอนปลาย โดยให้รับนักเรียนเป็นสหศึกาษา ตามคำสั่งกรมสามัญศึกษาที่ 3844/2530
ลงวันที่ 11 ธันวาคม 2530
พ.ศ. 2546 เข้าสังกัดเขตพื้นที่การศึกษาระยองเขต 1 สำนักงานการศึกษาขั้นพื้นฐานกระทรวงศึกษาธิการ
พ.ศ. 2555 โรงเรียนวัดป่าประดู่ อำเภอเมือง จังหวัดระยอง มีนักเรียนระดับมัธยมศึกษาตอนต้นและตอนปลาย จำนวน 2,948 คน จำนวนห้องเรียน
11 – 12 – 12 และ 10 – 10 – 10 รวม 65 ห้องเรียน
พ.ศ. 2564 โรงเรียนวัดป่าประดู่ เปิดแผนการเรียนห้องเรียนพิเศษ MEP (Mini English Program) ในระดับชั้นมัธยมศึกษาตอนปลายเป็นปีแรก
จำนวนห้องเรียน 16 – 16 -16 และ 9 – 8 – 8 รวม 73 ห้องเรียน และเปิดทำการเรียนการสอนในรูปแบบ On-site ภายหลังสถานการณ์การแพร่ระบาดของเชื้อไวรัส Covid-19
พ.ศ. 2565 เป็นปีแห่งการเฉลิมฉลอง เนื่องในวันคล้ายวันสถาปนาโรงเรียน ครบรอบ 100 ปี โดยมีการจัดพิธีทำบุญและมอบทุนการศึกาา อีกทั้งจัดกิจกรรม เดิน-วิ่ง เพื่อการกุศล “100 ปี โรงเรียนวัดป่าประดู่ มินิมาราธอน” เพื่อรวมพลังแห่งความศรัทธาในการร่วมพัฒนาโรงเรียนวัดป่าประดู่
พ.ศ. 2566 โรงเรียนวัดป่าประดู่ มีนักเรียนระดับมัธยมศึกษาตอนต้นและตอนปลาย จำนวน 2,740 คน จำนวนห้องเรียนครบตามแผนชั้นเรียน
16 – 16 -16 และ 9 – 9 – 9 รวม 75 ห้องเรียน เป็นปีที่นักเรียนแผนการเรียนห้องเรียนพิเศษ MEP (Mini English Program) ในระดับชั้นมัธยมศึกษาตอนปลายสำเร็จการศึกษาเป็นรุ่นแรกในปีการศึกษา 2566
พ.ศ. 2567 โรงเรียนวัดป่าประดู่ มีนักเรียนระดับมัธยมศึกษาตอนต้นและตอนปลาย จำนวน 2,803 คน จำนวนห้องเรียนครบตามแผนชั้นเรียน
16 – 16- 16 และ 9 – 9 – 9 รวม 75 ห้องเรียน